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實驗目的:此次實驗樣品為小鼠肝臟細胞核,為進一步提高樣品超聲破碎的實驗效率和效果的準確性,獲得高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù);此次實驗選用凈信科研者的高通量聲波基因組剪切儀設(shè)備對樣品細胞核進行實驗前處理。
實驗設(shè)備:高通量聲波基因組剪切儀 JXDNA-500PICO
小鼠肝臟細胞核樣品前處理實驗研磨操作過程:
1.在實驗開始前,需要先將冷水機設(shè)備注滿純水;另外再做實驗之前還需要先打開冷水機設(shè)備,對其進行預冷處理
2.在打開高通量聲波基因組剪切儀的主機電源后,需要讓水保持循環(huán)狀態(tài),直到達到4℃之后方可使用
3.在實驗設(shè)備達到預定的溫度之后,即可根據(jù)樣品的實驗需求去對設(shè)備的程序參數(shù)進行調(diào)節(jié)設(shè)置
4.把裝有樣品的離心管以對稱的形式放入儀器的適配器內(nèi)
5.對儀器程序的超聲模式需設(shè)為間歇超聲,超聲20s,間歇10s
6.待剪切儀使用完畢后,關(guān)閉冷水機與剪切儀電源,并將適配器擦干后安全放置
實驗操作注意事項:
1.每周至少換一次純水
2.儀器運轉(zhuǎn)時不可用外力強迫適配器旋轉(zhuǎn)馬達停止
3.超聲水槽內(nèi)必須保證有水才可以啟動超聲,不可無水超聲
4.冷水機的設(shè)定溫度是4℃,后期使用無需再次設(shè)置,打開電源即可
5.超聲波水槽不可用尖銳物品碰觸或刮擦,不可加入高鹽或腐蝕性液體
小鼠肝臟細胞核樣品前處理實驗超聲打斷結(jié)果:
高通量聲波基因組剪切儀對小鼠肝臟細胞核樣品的超聲實驗處理效果由上圖可看出,實驗設(shè)備對樣品的前處理實驗超聲打斷結(jié)果良好,可滿足樣品的實驗需求,能夠進一步提高樣品細胞超聲波破碎的實驗效率和效果的準確性,能夠獲得高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù)。
高通量超聲波基因組剪切儀采用等溫、非接觸的方式可對樣品進行打斷、勻漿和混合;實驗設(shè)備主要用于細菌細胞破碎、蛋白質(zhì)抽提、二代測序樣本DNA片段化、免疫共沉淀等實驗,它具有聲波聚焦,高效率低能耗、實驗重復性好、得率高等優(yōu)勢;高通量超聲波基因組剪切儀采用4℃低溫水浴超聲波,能量分布均勻,且能夠同時處理30個樣品,被廣泛用于分子生物學實驗中。